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4月14日8时，卫生部接到地震局通报，青海省玉树藏族自治州玉树县发生7.1级地震。卫生部对此高度重视，迅速成立了由卫生部部长陈竺和党组书记张茅任组长，三位副部长任副组长，部相关司局和单位为成员单位的卫生部青海省玉树地震卫生应急领导小组。领导小组立即召开会议，启动自然灾害卫生应急一级响应，分析研究灾区医疗救治和卫生防疫工作形势和任务，部署调动全国卫生力量开展医疗卫生救援工作。
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截至14日18：00时，卫生部门已派出青海、四川、西藏、甘肃共5支287人的医疗卫生救援队伍携带医药物资赶赴灾区，其中青海省123人的队伍和四川甘孜州71人的队伍已到达灾区开展伤员救治工作。卫生部还在全国组织了18支396人的专家组和60支1320人的医疗救援队伍随时待命。根据本次地震造成重大人员伤员、血液供应必然紧缺的情况，卫生部指导青海省和玉树州卫生部门做好血液采集和紧急供应工作，同时通知有关省份做好调运血液支援灾区的相关准备。同时，卫生部已要求中国疾病预防控制中心对灾区鼠疫防控形势进行分析评估，并将迅速组织落实防控措施，有效防范鼠疫暴发和流行。
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