自武汉市新型冠状病毒感染的肺炎疫情发生后，四川省疾控中心领导高度重视，于1月15日在中心应急大厅召开了省疾控中心成立新型冠状病毒感染的肺炎疫情处置领导小组和专业技术小组会议。中心主任吴先萍和党委书记古熙担任领导小组组长，中心副主任担任副组长，全面负责疫情应对处置的领导和决策；下设五个专业技术组。
随着疫情形势的变化，根据习近平总书记、李克强总理和彭清华书记、尹力省长对新型冠状病毒感染的肺炎疫情作出的重要指示精神和国务院电视电话会议精神，于1月24日中心对领导小组及专业技术组进行了调整和增强，专业技术组由5个增加到8个，成员达到140余人；应急队由2支扩大到7支。八个专业技术组分别是综合协调组、疫情研判处置组、实验检测组、信息舆情组、宣传教育组、后勤保障组、督导组、纪律检查组。
吴先萍主任明确了各组防控工作职责，要求各组严格按照“四快一稳一整治” 的原则，根据国家最新的治疗方案、防控方案、指南和相关要求开展各项工作强化责任落实和分工协作；要求各组实行AB角，建立了值班值守制度，成员保持24小时通讯畅通，疫情研判处置组24小时待命；要求必须有条不紊、紧张有序地开展新型冠状病毒感染的肺炎疫情的应对与处置工作。她强调，要依法科学有序防控，坚决遏制疫情扩散，守护四川。
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