为有效应对新冠肺炎等新发传染病，快速处置突发疫情，并精准溯源，市疾控中心购入高通量二代、三代测序仪及卫生应急移动检测车，给自贡市的传染病病原快速鉴定和溯源提供高端技术平台。
设备采购到位后，迅速完成了高通量二代、三代测序仪的安装测试、专业技术人员的培训学习及上机实操，掌握了RNA定量、文库构建、测序模板制备、上机测序、数据分析等各项技术。近日，中心顺利完成二代及三代测序的实验运行，经数据分析测序数据质量高，完成了完整序列组装，达到了病原溯源工作的要求，有效填补了我市在高通量测序方面的空白。
高通量测序主要运用于已知病原全基因组序列的测定与分析，新冠疫情中获得新冠全基因组序列，通过序列比对分析，对新冠疫情溯源、尤其是是为应对目前新冠疫情中“德尔塔”新冠病毒提供了有力的保障；同时也可对不明原因感染样本进行宏基因组分析，检测是何种病原导致的感染。近日，中心对我市1例境外返乡复阳新冠患者的样本进行了新冠全基因组测序分析，获得了该样本中新冠病毒全基因组80%的序列，与省疾控测序结果一致。
高通量测序成功标志着自贡市疾控中心实验室检测迈入了全基因组时代，也代表中心具备了新冠病毒测序能力，大大提高了疫情防控技术水平，为自贡市疾控中心新型冠状病毒疫情以及其他传染病病原体的鉴定和溯源、防控应对提供了强大的技术支撑。今后工作中，中心将继续发挥该仪器设备作用，加强与国家、省疾控中心和科研院所等合作，引进新项目，培育新成果，搭建自贡地区高通量测序技术平台，使其切实服务于全市人民健康。
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