如果把流调溯源工作比做侦探在蛛丝马迹中寻找线索，那么病毒基因测序更像是“法医”工作，为“侦探”提供“实锤”的证据，从病原学的角度更准确地认定病毒的来源。

10月23日，自贡市富顺县发生输入性病例，此次输入性疫情的新冠病毒核酸样本被立即送到自贡市疾控中心微生物检验所，在这里进行了新冠病毒全基因组测序。

整夜未眠只为一个结果

10月23日那个夜晚，自贡疾控中心微生物检验所的灯彻夜亮着，实验室人员在等一个结果，全市人民也在等一个结果。

10月23日晚9点多，来自富顺县患者的样本核酸送达微生物检验所副所长王斌的手中，这是我市继今年8月以来的又一起省外输入新冠肺炎确诊病例。拿到样本核酸后，测序小组立即开展了新冠病毒全基因组测序工作。

病毒基因测序，可以在第一时间获取病毒的基因组序列信息，已成为研究疾病暴发、追踪溯源的重要工具。通过检测新冠病毒的全基因组序列，再将这个序列通过软件分析与数据库中的序列进行比对，可以准确地判断其地域来源及这些病例是否来自同一传播链或传染源。

基因测序需要经过核酸提取、目的基因的捕获、扩增、纯化、建库等步骤，这些看似简单的流程，却需要十分精细的操作和计算。实验室的灯光通宵点亮，25日凌晨1点多，经过测序小组的连夜“奋战”，经过基因测序仪数小时的运算分析，序列分析比对，结果证明此次富顺患者感染的新冠病毒为“德尔塔”病毒株，与内蒙古额济纳旗疫情其他病例毒株高度同源。

未雨绸缪技术攻关

早在2020年新型冠状病毒肺炎疫情刚发生时，自贡疾控中心就已组织相关专家讨论防控策略，多次送培专业技术人员前往国家疾控中心、四川省疾控中心和华大智造学习测序与分析技术，积极开展技术、设备、人员储备，同时迅速组织成立测序小组，熟悉相关技术流程，制定操作规程，做好各环节的准备，为我市迅速开展新冠病毒测序分析及溯源工作夯实了基础。

“在德尔塔病毒来临之前，我们已做好充分的技术准备”。

准确鉴定精准溯源

今年8月我市荣县发生1例无症状感染者复阳疫情，自贡市疾控中心实验室通过开展全基因组测序，确定该无症状复阳患者病毒阳性样本基因序列不全，正是基于这个判断，结合流行病学调查结果，我市及时调整完善相关防控措施，快速处置疫情，安稳了民心。

10月24我市富顺县发生的1例输入性新冠核酸阳性无症状感染者，中心立即启动开展三代、二代测序工作，测序结果分析为德尔塔（Delta）毒株，与省疾控中心测序结果一致，经中国疾控中心比对分析，我市感染者基因组完整度高（96.8%），为Delta突变株，与内蒙古额济纳旗疫情其他病例毒株高度同源，成功的测序溯源为我市该起疫情处置提供了精准的科学依据。

自贡疾控实验室快速反应、成功溯源新冠病毒“德尔塔”突变株，第一时间测序溯源病例毒株，为我市疫情处置提供了精准的科学依据，受到国家疾控和省疾控高度好评，这也是除四川省疾控中心、成都市疾控中心以外，四川省内能独立开展新冠病毒基因测序的地市级疾控中心。