近日,自贡市疾控中心引进第三代宏基因组测序平台,包括开放式全自动文库制备系统、三代高通量纳米孔测序系统、全自动可视化测序数据分析系统,可实现病原微生物基因组测序和本地数据溯源分析,为我市重大传染病疫情处置实验室检测能力提供了重要技术平台。
该平台设备采购到位后,已完成第三代宏基因组测序仪、全自动样本文库制备系统、高通量宏基因组数据分析系统安转及调试,同时对中心专业人员进行了理论培训学习及样本上机检测全流程实操,掌握了样本制备、文库构建、上机测序、数据分析等各项技术。并运用于致病菌识别网健康人群肠道和呼吸道病原和耐药专项监测的样本测序分析。
三代测序技术基于纳米孔单分子测序技术,相比于二代测序具有长读长、建库迅速、可进行实时测序分析、设备维护简单等优点。
在后疫情时代的背景下,国家疾控对病原微生物的监测和检测提出了更高的要求,对于未知或突变的传染性病原感染,越快越完整的得到全基因组序列信息,越有利于疫情防控。中心建立第三代测序平台是基于传染性未知病原爆发疫情防控的艰难性、复杂性、反复性和长期性,抓住改革发展的战略性机遇,补齐了当前病原检测工作中存在的短板和弱项,提升了疫情防控能力。
中心成功引进第三代测序平台,标志着中心实验室检测在基因组时代又进了一步,大大提升了中心传染病疫情防控技术水平。同时也建成了川南首个第三代高通量测序平台,提升中心在川南疾控中的实验室检验检测能力,为中心创建区域疾控中心作出贡献。今后工作中,中心将持续发挥该平台作用,加强与国家疾控中心、省疾控中心、科研院所等合作,持续提升中心检验检测能力。
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